Die Abteilung in der jetzigen Form besteht seit knapp 30 Jahren.
Die Leitung der Schwimmabteilung wurde 1994 von Norbert Wimmer übernommen.
Seit 1994 wurde auch der Trainingsbetrieb und der Aufbau einer Wettkampfmannschaft begonnen. Der TV Eggenfelden wurde 1995 beim BSV für den Wettkampfbetrieb angemeldet und startete ab diesem Zeitpunkt den stetigen Aufstieg zur Niederbayerischen Spitze, erfolgreichen Teilnahmen und Titeln bei Bayerischen und Deutschen Meisterschaften bis hin zur Teilnahme und auch Medaillemgewinn an den Masters-Weltmeisterschaften. Sogar mehrere Weltmeistertitel konnten für den TVE bei den Transplantierten durch Emeran Neuhäuser erschwommen werden. Einige Schwimmer, die beim TVE groß geworden sind wechselten aufgrund der besseren Möglichkeiten zum SV Wacker Burghausen, wo sie bei einem der über lange Jahre bundesweit führenden Vereine auch sehr gute Erfolge landen konnten.
Ohne Übertreibung kann man die Schwimmabteilung des TVE als einen der erfolgreichsten
Vereine (Sparten) der letzten Jahre in Eggenfelden bezeichnen.
Im Sommer 2021 wird die Abteilung Schwimmen
von Steven Hartnack als neuen Spartenleiter übernommen.